scvi.external.ContrastiveVI
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.. autoclass:: ContrastiveVI



Attributes table
~~~~~~~~~~~~~~~~~~

.. autosummary::

    ~scvi.external.ContrastiveVI.adata
    ~scvi.external.ContrastiveVI.adata_manager
    ~scvi.external.ContrastiveVI.device
    ~scvi.external.ContrastiveVI.history
    ~scvi.external.ContrastiveVI.is_trained
    ~scvi.external.ContrastiveVI.summary_string
    ~scvi.external.ContrastiveVI.test_indices
    ~scvi.external.ContrastiveVI.train_indices
    ~scvi.external.ContrastiveVI.validation_indices





Methods table
~~~~~~~~~~~~~

.. autosummary::

    ~scvi.external.ContrastiveVI.convert_legacy_save
    ~scvi.external.ContrastiveVI.deregister_manager
    ~scvi.external.ContrastiveVI.differential_expression
    ~scvi.external.ContrastiveVI.get_anndata_manager
    ~scvi.external.ContrastiveVI.get_from_registry
    ~scvi.external.ContrastiveVI.get_latent_library_size
    ~scvi.external.ContrastiveVI.get_latent_representation
    ~scvi.external.ContrastiveVI.get_normalized_expression
    ~scvi.external.ContrastiveVI.get_salient_normalized_expression
    ~scvi.external.ContrastiveVI.get_specific_normalized_expression
    ~scvi.external.ContrastiveVI.load
    ~scvi.external.ContrastiveVI.load_registry
    ~scvi.external.ContrastiveVI.register_manager
    ~scvi.external.ContrastiveVI.save
    ~scvi.external.ContrastiveVI.setup_anndata
    ~scvi.external.ContrastiveVI.to_device
    ~scvi.external.ContrastiveVI.train
    ~scvi.external.ContrastiveVI.view_anndata_setup
    ~scvi.external.ContrastiveVI.view_setup_args





Attributes
~~~~~~~~~~~



.. autoattribute:: ContrastiveVI.adata

.. autoattribute:: ContrastiveVI.adata_manager

.. autoattribute:: ContrastiveVI.device

.. autoattribute:: ContrastiveVI.history

.. autoattribute:: ContrastiveVI.is_trained

.. autoattribute:: ContrastiveVI.summary_string

.. autoattribute:: ContrastiveVI.test_indices

.. autoattribute:: ContrastiveVI.train_indices

.. autoattribute:: ContrastiveVI.validation_indices






Methods
~~~~~~~



.. automethod:: ContrastiveVI.convert_legacy_save

.. automethod:: ContrastiveVI.deregister_manager

.. automethod:: ContrastiveVI.differential_expression

.. automethod:: ContrastiveVI.get_anndata_manager

.. automethod:: ContrastiveVI.get_from_registry

.. automethod:: ContrastiveVI.get_latent_library_size

.. automethod:: ContrastiveVI.get_latent_representation

.. automethod:: ContrastiveVI.get_normalized_expression

.. automethod:: ContrastiveVI.get_salient_normalized_expression

.. automethod:: ContrastiveVI.get_specific_normalized_expression

.. automethod:: ContrastiveVI.load

.. automethod:: ContrastiveVI.load_registry

.. automethod:: ContrastiveVI.register_manager

.. automethod:: ContrastiveVI.save

.. automethod:: ContrastiveVI.setup_anndata

.. automethod:: ContrastiveVI.to_device

.. automethod:: ContrastiveVI.train

.. automethod:: ContrastiveVI.view_anndata_setup

.. automethod:: ContrastiveVI.view_setup_args